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Le Conservatoire des Sols est d'ores et déjà lié à de nombreux programmes :

Deux programmes nationaux qui sont coordonnés par l'unité génèrent des échantillons gérés par le conservatoire :

RMQS (1ère campagne 2001- 2008 ; 2ème campagne 2011-2018, etc.))
Réseau de Mesures de la Qualité des Sols

Coordinateur : C. Jolivet, Unité InfoSol

Résumé :
Ce programme repose sur le suivi de 2200 sites régulièrement répartis sur le territoire français, selon une grille de maille carrée de 16 km de côté. Tous les échantillons de ce programme sont stockés au Conservatoire des Sols. Pour plus d'informations sur ce programme voir : http://www.gissol.fr/programme/rmqs/rmqs.php

IGCS
Inventaire Gestion et Conservation des Sols

Coordinateur : D. Arrouays, Unité InfoSol

Résumé :
Ce programme concerne tous les travaux de cartographie des sols réalisés en France à différentes échelles. Il génère de nombreux échantillons de sols que le Conservatoire des Sols se propose d'accueillir. Pour plus d'information sur ce programme voir : http://www.gissol.fr/programme/igcs/igcs.php

Programmes de Recherche en cours qui font appel aux échantillons gérés par le conservatoire et aux données associées gérées par l'unité :

DGT (2008-2009)

Evaluation de la technique DGT "Diffusive Gradients in Thin films" pour caractériser la phyto-disponibilité des éléments traces dans les sols agricoles : application aux échantillons de sols du Réseau de Mesures de la Qualité des Sols (RMQS)

Coordinateur : L. Denaix, INRA Bordeaux

Partenaires :

• Unité InfoSol de l'INRA d'Orléans
• TCEM INRA Bordeaux
• USRAVE INRA Bordeaux

Résumé :
La technique DGT est un dispositif associant des résines chélatantes inclues dans un gel de polyacrylamide et un gel de diffusion de porosité connue. Elle permet de classer les sols en fonction de leur capacité à réalimenter la solution du sol. Si on l'applique au transfert sol-plante, cette méthode permet de quantifier la disponibilité physicochimique vis-à-vis des végétaux.
Le programme DGT concerne 100 sites du RMQS sélectionnés sur des critères physico-chimiques (variabilité la plus forte possible pour l’ensemble des paramètres). Ces sites ont été choisis parmi les sites cultivés (prairies permanentes et forêts ont été exclus, vigne et vergers ont été intégrés).

POP-RMQS (2008-2009)

Détection des polluants organiques persistants dans les sols (HAP, OCP, dioxines et furanes, herbicides), analyse de faisabilité sur la base d’un sous - échantillonnage du RMQS

Coordinateur : D. Arrouays, Unité InfoSol

Partenaires :

• Unité InfoSol de l'INRA Orléans
• LAS, INRA d'Arras
• INRA de Grignon
• AFSSET (Agence Française de Sécurité Sanitaire de l‘Environnement et du Travail)
• IFEN (Institut Français de l’environnement)
• ADEME (Agence De l’Environnement et de la Maitrise de l’Energie)

Résumé :
Ce programme concerne 183 sites du Réseau de Mesure de la Qualité des Sols. Les POP sont des molécules toxiques à forte persistance dans l’environnement avec des propriétés de bioaccumulation et de transport longue distance. Pour ce programme, une gamme de HAP (Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques), de PCB (PolyChloroBiphényles), de PCDD (PolyChloroDibenzoDioxines), de PCDF (PolyChloroDibenzoFuranes) d’OCP (Pesticides OrganoChlorés), de Triazines et d’Urées substituées est mesurée.

ECOMIC-RMQS (2006-2009)

Projet ANR Biodiversité : Microbio-géographie à l’échelle de la France par l’application d’outils moléculaires au RMQS.

Coordinateur : L. Ranjard, UMR INRA/UB 1229 Microbiologie du Sol et de l’Environnement, INRA Dijon.

Partenaires :

• UMR Microbiologie du Sol et de l’Environnement - INRA/Université de Bourgogne et Plateforme GENOSOL (http://www2.dijon.inra.fr/plateforme_genosol/);
• Unité InfoSol de l'INRA d'Orléans;
• Laboratoire AMPERE (ex CEGELY) UMR CNRS 5005;
• Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR CNRS 5558 Lyon 1;
• UMR INRA/Agro Montpellier Analyse des systèmes et biométrie;
• CEFE-CNRS DREAM Unit, Montpellier.

Résumé :
Le programme ANR "ECOMIC-RMQS" a pour objectif de comprendre les processus qui génèrent et maintiennent la biodiversité microbienne des sols, notamment par une meilleure estimation et une caractérisation de la diversité des communautés à l’échelle du paysage. Ce programme s’appuie sur le RMQS (Réseau de Mesure de la Qualité des Sols). Les communautés bactériennes indigènes des sols sont caractérisées au moyen d’une extraction de l’ADN de l’ensemble des sols du RMQS, afin de générer les empreintes génétiques des communautés bactériennes indigènes. L’initiation d’un couplage d’étude d’écologie microbienne au RMQS a permis la mise en place d’une ADN-thèque des sols français au sein de la plateforme GenoSol (http://www2.dijon.inra.fr/plateforme_genosol/presentation.php), qui est reliée à la base de données DoneSol et au Conservatoire des Sols. Ce projet aboutira à la constitution d’une première base de données d’empreintes génétiques des communautés microbiennes des sols français, qui permettra à terme de nous orienter vers une cartographie microbiologique des sols à l’échelle régionale et nationale.

DRX-RMQS métropole (2007-2009)

Intérêt de l’apport d’informations sur la composition minéralogique obtenues par Diffractométrie de Rayons X pour la compréhension du fonctionnement des sols, application au RMQS,

Coordinateur : C. Jolivet, Unité InfoSol

Partenaires :

• Unité InfoSol de l'INRA d'Orléans
• Unité de recherche Science du Sol de l'INRA d'Orléans

Résumé :
Ce projet s’inscrit dans le cadre d’une collaboration entre l’UR Science du Sol et l’US InfoSol, afin de réaliser un inventaire systématique de la minéralogie sur poudre totale des horizons de surface des sites du RMQS. Dans un premier temps, il a été choisi d’analyser les échantillons de Bretagne (35, 29, 22, 56) (116 échantillons), du Limousin (87, 23, 19) (68 échantillons) et de la région Centre (41, 28, 37, 45, 36, 18) (161 échantillons) dans la mesure où ces zones sont par ailleurs caractérisées en télédétection par le BRGM qui a recueilli des données de rayonnement gamma et de signatures multispectrales. Les différentes sources de données seront ainsi confrontées (collaboration BRGM, INFOSOL, Science du Sol).

DRX-RMQS Antilles (2007-2009)

Intérêt de l’apport d’informations sur la composition minéralogique obtenues par Diffractométrie de Rayons X pour la compréhension de la pédogénèse des sols des Antilles françaises, application au RMQS,

Coordinateur : D. Arrouays, Unité InfoSol

Partenaires :

• Unité InfoSol de l'INRA d'Orléans
• Unité de recherche de Science du Sol de l'INRA d'Orléans
• Unité de recherche Agropédoclimatique de la zone caraïbe de l'INRA

Résumé :
Ce projet va permettre de contribuer à la compréhension de la pédogenèse des sols de la Guadeloupe et de la Martinique, en s’appuyant sur une analyse de la composition minéralogique obtenue par Diffractométrie de Rayons X sur poudre et lames orientées, à partir des échantillons de sols des sites du RMQS.

RMQS-MIRSOL 2008-2010

Développement d’une méthode rapide de caractérisation des propriétés bio-physico-chimiques des sols de France : application de la technique MIRS au RMQS

Coordinateur : Martial BERNOUX (IRD)

Partenaires :

• UR179 SeqBio "Séquestration du Carbone et Biofonctionnement des sols" de l'IRD
• Unité InfoSol de l'INRA d'Orléans

Résumé :
La spectroscopie dans le moyen infrarouge (MIRS : Mid-Infrared Reflectance Spectroscopy) permet des dosages rapides et non destructifs des divers constituants et propriétés des sols. La spectrométrie moyenne infrarouge caractérise l’absorption par les molécules organiques (et l’eau) d’une énergie lumineuse de longueurs d’ondes dans la gamme 2500-25000 nanomètres (4000 – 400 cm–1). Quelques exemples d’utilisation de cette méthode ont été récemment développés et montrent une très bonne quantification de composés organiques sur le sol total ou des fractions physico-chimiques comme par exemple les groupements O-alkyle, carboxyle et divers composés aromatiques. La technologie MIRS permet de déterminer rapidement et à faible coût de tels paramètres qui ne sont pas analysables en routine sur un grand nombre d’échantillons.
Ce projet propose d’établir dans un premier temps des fonctions de prédictions liées à la matière organique et aux Éléments Traces Métalliques (ETM) à partir des analyses réalisées en routine sur les échantillons du RMQS. Dans un second temps le projet, via l’implémentation d’une base de données spectrales de référence, permettra de prédire les constituants et paramètres non analysés en routine à partir d’un sous-échantillon représentatif d’une gamme de variation défini par la base MIRS sur lequel on réalisera des analyses spécifiques.

PATHO-RMQS 2008-2011

Projet ANR" Santé environnement" : Répartition géographique des bactéries pathogènes de l'Homme dans les sols: effet des constituants et de l'urbanisation.

Coordinateur : Sylvie Nazaret CNRS, Lyon

Partenaires :

• UMR CNRS 5558 Ecologie Microbienne UCB LYON1
• UMR 1229 Microbiologie des Sols et Environnement; INRA/ Université de Bourgogne
• Unité InfoSol de l'INRA d'Orléans
• UMR CNRS 5557 Biométrie et Biologie Evolutive
• DTAMB IFR 41 -UCB LYON1

Résumé :
Les principaux objectifs de ce projet sont i) d' évaluer le potentiel du sol à constituer un réservoir i.e. milieu assurant la survie, le développement et la dispersion de bactéries pathogènes de l’homme et ii) de hiérarchiser les facteurs abiotiques (facteurs climatiques et physico-chimiques, distribution floristique, source de contamination, fertilisation, usage de pesticides) et biotiques (densité, structure génétique des communautés bactériennes indigènes) favorables à la survie, au développement et à la dispersion de bactéries pathogènes. Patho-RMQS vise à étudier la distribution de pathogènes humains dans les sols français via une stratégie d’échantillonnage portant sur l’ensemble du territoire métropolitain (échantillonnage exhaustif, standardisé, représentatif de différents types et modes d’exploitation du sol, qui s’appuie sur le réseau RMQS) et à comprendre l’influence des facteurs abiotiques et biotiques sur la dynamique de ces pathogènes. Les pathogènes ciblés sont des pathogènes "primaires" (Listeria monocytogenes, Salmonella typhimurium, Clostridium difficile, Enterococcus faecalis, Leptospira, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Burkholderia pseudomallei) et des pathogènes opportunistes (Pseudomonas aeruginosa, B. cenocepacia, B. multivorans, Stenotrophomonas maltophilia, Nocardia asteroides, Acinetobacter baumanii, Achromobacter xylosoxidans, Aeromonas hydrophila, A. caviae) se différenciant également par leur distribution présupposée dans l’environnement (aquatique, animal/humain, sols/rhizosphère).

Biosoil

Coordinateur : JL Flot, DSF, Ministère de l’Agriculture

Partenaires :

• Inventaire Forestier National
• INRA Unité InfoSol
• INRA Laboratoire d’Analyse des sols Arras.
• JRC ISPRA, Italie

Résumé :
Le programme BioSoil est un programme initié par la commission européenne sur la surveillance des sols forestiers d’Europe. Il se fonde sur un maillage systématique de 16x16 km parfaitement compatible avec la maille du RMQS. Les modes de prélèvement et d’analyse décidés à l’échelle européenne étant différents de ceux retenus dans le cadre du RMQS, c’est un double échantillonnage qui a été réalisé sur chaque site (environ 570 sites en France). Les analyses sont réalisées au laboratoire d’analyse de sols de l’INRA d’Arras. Les échantillons du réseau Biosoil sur la France sont stockés au Conservatoire des Sols.

RMQS-BIODIV

Projet ADEME - Etude de la composante biologique des sols à l'aide d'un échantillonnage systématique à l'échelle régionale (Bretagne)

Coordinateur : D. Cluzeau, UMR EcoBio, Université Rennes

Partenaires :

• Unité InfoSol de l'INRA d'Orléans
• UMR CNRS 5176 de Brunoy
• UR IRD Montpellier Seq Bio
• UMR INRA Rennes Bio3P
• IRD Bondy
• UMR MSE INRA/UB Dijon
• ENSAIA/INPL
• UMR CNRS Ecobio Université de Rennes

Résumé :
Ce projet a pour objectifs scientifiques de faire l’évaluation, à une échelle régionale, de paramètres biologiques définissant l’état de la diversité structurelle et fonctionnelle de certains groupes d'organismes (essentiellement microflore et de la faune du sol) et leurs relations possibles avec les variables agro-pédologiques (type de sol, usage et pratiques) dans les sols tempérés. Ces paramètres biologiques sont actuellement essentiellement utilisés par des laboratoires de recherche, soit en routine (faisant l’objet d’une norme ou document de travail pré-normatif), soit en cours d'évaluation de faisabilité à l’échelle locale.